如今的齐齐哈尔医学院附属第三医院是集医疗、教学、科研、预防、保健于一体的省内一流高水平学术型医院。1991年成为全国首批、黑龙江省首家三级甲等医院，2010年通过黑龙江省第二周期医院等级评审验收，再次成为齐齐哈尔市首家三级甲等医院。现有东西两个院区，下设有齐齐哈尔市肿瘤医院、美国Fox Chase癌症中心齐齐哈尔分中心、消化分院、心血管分院、2个社区卫生中心、80余个临床医技科室、14个教研室。编制床位2000张，占地面积8万余平方米，建筑面积超过16.1万平方米。现有职工2400余人，高级职称以上的专业技术人员近400人，硕士生、博士生学历占专业技术人员总数的20%。